山东科技大学研究生教育始于1979年，是国务院学位委员会批准的首批具有硕士学位授予权的单位，1995年被国务院学位委员会批准为博士学位授予单位，2003年经国家劳动人事部批准设立博士后科研流动站。1991年被原国家教委批准为具有单独组织硕士生招生入学考试权的单考单位，1997年被国务院学位委员会批准为有权开展以研究生毕业同等学力申请硕士学位的工作单位，2001年被国务院学位委员会批准为工程硕士授权单位，2010年被教育部确定为首批全国专业学位研究生教育综合改革试点单位；2013年正式设立研究生院。

截至2026年3月，学校在校研究生总数为11466人，其中博士生866人，硕士生10600人，其中包含非全日制硕士研究生1677人。2025年学校招收博士生201人；硕士生3668人，其中全日制研究生3183人，非全日制研究生485人。

研究生院与学科建设办公室合署办公，负责学校学位与研究生教育、研究生教育管理、学科建设的宏观管理工作，在青岛、泰安、济南三个校区均招收研究生。现设有研究生招生办公室、培养办公室、学位与质量监督评估办公室、学科建设办公室、学籍与信息管理办公室、研究生教育管理办公室等6个办公机构，现有工作人员17人。

经过40多年的发展，学校在工学、理学、管理学、文学、法学、经济学、艺术学、教育学等八大学科门类中授予博士或硕士学位。目前有11个博士学位授权一级学科，1个博士专业学位类别，33个硕士学位授权一级学科，22个硕士专业学位类别。目前学校有国家重点（培育）学科1个，山东省一流学科建设“811”项目潜力学科2个，山东省高水平学科4个，山东省一流学科5个，另有省市级重点学科21个。工程学、数学、化学、材料科学、地球科学、计算机科学、环境与生态学等7个学科进入ESI全球排名前1%，工程学、数学2个学科进入ESI全球排名前1‰。